Der Agenda VR3 enthält einen Flashbereich fü den Kernel und das Root-Dateisystem, das read-only gemountet wird. Der zweite Flashbereich enthält ein Dateisystem, das unter /flash gemountet wid. Hier sind die Verzeichnisse zu finden, deren Inhalt nicht konstant bleibt, wie z.B. das /etc Verzeichnis für Konfigurationen, das Home-Verzeichnis, ... Diese Verzeichnisse werden in die entsprechendnen Stellen des Verzeichnisbaums gelinkt. Im folgenden ist kurz der Verzeichnisbaum skizziert, um das Prinzip zu verdeutlichen:
/ +- bin +- defaults Firmware Defaults für /flash +- dev --> /flash/dev +- etc --> /flash/etc +- flash das zweite Dateisystem, beschreibbar +- dev +- dev +- home +- default +- local +- bin +- lib +- mnt +- mt +- root +- home --> flash/home +- lib +- log +- mnt -->/flash/mnt +- proc +- ram +- root --> /flash/root +- sbin +- tmp --> /flash/tmp +- usr +- bin +- doc +- etc +- lib +- local --> /flash/local +- man +- man +- sbin +- share +- src +- X11R6 +- var --> flash/var